杭州师范大学学术期刊社于2009年在原杭州师范大学学报编辑部的基础上组建而成，负责对校办学术期刊的管理、组织等工作，出版《杭州师范大学学报（社会科学版）》《杭州师范大学学报（自然科学版）》《健康研究》三刊。其中《杭州师范大学学报（社会科学版）》是人文社科类综合性学术期刊，双月刊，先后入选CSSCI来源期刊、CSSCI 扩展版来源期刊、全国中文核心期刊、中国人文社会科学综合评价AMI核心期刊、RCCSE核心学术期刊，被评为全国百强社科期刊、全国高校精品社科期刊、华东地区优秀期刊、浙江省一级期刊、浙江省期刊方阵工程优秀期刊；《杭州师范大学学报（自然科学版）》是自然科学类综合性学术期刊，双月刊，现为中国科技核心期刊，被美国《化学文摘》（CA）、波兰《哥白尼索引》（IC）、德国《数学文摘》、《中国数学文摘》等国内外检索系统收录，多次获评中国高校优秀科技期刊；《健康研究》为医学类综合性学术期刊，双月刊，入选浙江省医药卫生期刊名录，被美国《化学文摘》（CA）、美国《乌利希期刊指南》（UPD）、日本科学技术振兴机构数据库（JST）、中国生物医学文献数据库等国内外数据库收录，先后获评中国高校优秀科技期刊、中国科技论文在线优秀期刊等。

期刊社现有成员12名，其中：专业技术人员11人；具有正高职称3人、副高职称4人；拥有博士学位7人。

期刊社现任社长朱晓江编审，副社长冯学勤教授。